Scusami, ma mi sono perso ... per strada.
E' giusto che tu abbia le due cartelle, quella IMAPMAIL contiene le sottocartelle che hai appunto in Imap collegate all'account mentre l'altra, MAIL, contiene le sottocartelle create in locale, presumo precedentemente con POP (che non lo uso più da molti anni quindi mi baso su ricordi lontani).
Penso, ma ti conviene in ogni caso attendere pareri autorevoli in materia, che tu possa vedere le sottocartelle e quindi le mail contenute nella cartella MAIL creando delle nuove sottocartelle specifiche nel menù delle cartelle locali.