Dunque, ho provato a modificare direttamente il file del profilo (prefs.js) usando blocco note e la modifica l'ha presa mentre se faccio qualsiasi modifica con Thunderbird non la prende, nel senso che anche quando clicco su "OK" dopo che ho fatto la modifica, non lo prende e rimane aperta la paginetta del profilo.
Ho letto che in Windows, avere la cartella con la spunta su "solo lettura" non conta nulla, l'importante è che il file non sia in sola lettura, e in effetti il file del profilo è modificabile.
edit: ho anche provato a cancellare il file del profilo e quando lo ha ricreato ha fatto lo stesso difetto, non salva.
ri-edit: visto che il file del profilo è un java, ho anche installato il programma ma non è cambiato nulla.