Ciao. Se questa cosa ti capita con più siti web è possibile che tu abbia qualcosa che non va nel tuo client.
Se invece ti riferisci a un solo sito web in particolare, che si comporta in modo più che invasivo, la risposta è "certo", puoi impedirgli di aprire popup con ABP (creando regole che li blocchino in apertura), ma considera che se si tratta di un sito web pirata, cambierà spesso "fonte popup" e ti toccherà di starci dietro per diverso tempo prima di andare in bolla.
Trovi informazioni sulla scrittura filtro qui:
https://adblockplus.org/filters#options (ti rimando proprio al paragrafo relativo a "Specifying filter options", in cui troverai il richiamo ai popup).