Ciao,
non sono espertissimo con Thunderbird (fossero stati problemi Firefox sarei stato più utile) ma hai provato nella webmail di Libero (non in Thunderbird) a spostare quel messaggio in una cartella diversa da quella della posta in arrivo per vedere se è la causa della mancata ricezione dei messaggi successivi forse per una malformazione?
Verifica se per caso anche qualcuno dei messaggi successivi può essere la causa del problema.
Non so se questa prova possa essere utile. Eventualmente attendi il parere di qualcuno più esperto di me