Di nulla.
Potresti provare però questa mossa: sostituisci la sola cartella del programma con una nuova scaricata dal sito (non dici qual è la versione portable da te utilizzata, ma tutte le portatili hanno sempre una cartelal riservata al programma vero e proprio ed una riservata ai relativi dati).
Se il problema è nella cartella del programma (come spero per te), allora lo risolvi facilmente.
Se è nella cartella del profilo (come temo) allora è più difficile, io ad esempio non ho mai avuto quel problema e non ho idea di quale file trovare nella cartella del profilo che blocca l'avvio (lock? parent.lock? crash-report? Boh!).