Ho capito il problema anche se al momento non saprei dirti una soluzione.
Ci sono pagine in cui l'esecuzione di alcuni script va in pausa quando la scheda non è più in primo piano. Bisogna attendere con la scheda in primo piano che lo script termini. Vorresti che diventi possiblie navigare in altre schede, tenendo queste altre schede in primo piano, e allo stesso tempo far credere, in qualche modo, che anche la scheda con lo script esigente sia in primo piano.