ciao
m75una domanda... ma in che stato sono i messaggi sul server?
da leggere, già letti, speciale eccetera...
Thunderbird, scaricare SOLO i messaggi "da leggere" dal server, gli altri li ignora,
se non li viene detto diversamente nelle impostazioni locali o sul server appunto.
fai un controllo / prova, se scarica tutti i messaggi indistintamente o solo quelli con qualche stato particolare.