Dipende se in TB preferisci mettere in comune tutte le "cartelle speciali" dei vari account (come faceva anche Oulook Express… soluzione che preferisco, e che in TB è chiamata "Global Inbox") o se preferisci tenere distinte le "cartelle speciali" dei singoli account (come fa WLM… soluzione secondo me scomodissima).
In ogni caso, una volta scelta la "configurazione" degli account (Global Inbox o cartelle separate), sposterai le "cartelle importate" dove preferisci (cosa che puoi fare con comodo anche più avanti… magari dopo aver provato per un po' TB).
A quel punto potrai anche creare eventuali "filtri" sulla posta…