Provo ad andare a naso:In Thunderbird 3.0 per ogni filtro, in "Applica il filtro" si può scegliere fra queste possibilità:
Applica il filtro manualmente 
I Filtri vengono applicati a mano, cioè devi tu applicare il filtro una volta arrivati i messaggi
Applica il filtro durante il controllo della posta o manualmente 
Di base viene applicato il filtro automaticamente da TB una volta arrivata la posta e puoi avviarlo tu manualmente, magari modificandone uno al volo DOPO l'arrivo della posta
Applica il filtro durante il controllo della posta (dopo la classificazione) 
Applicazione 
atuomatica del filtro DOPO l'arrivo della posta e DOPO che ai messaggi è stata applicata una classificazione 
Applica il filtro durante il controllo della posta (dopo la classificazione) o manualmente 
Come la precedente solo che hai la possibilità di farlo ANCHE manualmente DOPO l'arrivo della posta e DOPO che ai messaggi è stata applicata una classificazione 
spero di non aver detto frgnacce... ma è meglio che un mod eventualmente confermi...