esatto, se copi tutto, è come se stessi utilizzando il vecchio profilo...
Per risolvere il problema invece devi usare un profilo nuovo, e poi importare solamente i file necessari, come segnalibri, password, ecc...
Eventualmente puoi anche tentare di recuperare qualche impostazione dal file prefs.js, ma te lo sconsiglio a meno che tu non sappia esattamente cosa stai facendo.