Lasciare Thunderbird minimizzato nella tray (minimize to tray, estensione, vedi eXtenZilla.org), per le webmail, dipende se permettono o meno lo scaricamento da pop3 (altrimenti aspetti il componente webmail o scarichi freepops, ma qui non forniamo aiuto su freepops.)
Per impostare i pop3 di solito uso Mani 2.0 associata a Guarda i dati dell'account sul sito della webmail 0.2 Alpha.
Cosa intendi esattamente con "configurare gli account pop3"?