Dei due messaggi che mi hai mandato, uno si comporta normalmente (messaggio.eml), l'altro (Fwd.eml) invece no, mostrando l'anomalia che hai descritto (l'allegato si vede solo cliccando sul messaggio).
La ragione è che è il mimetype di questo messaggio è errato, visto che risulta essere "multipart/alternative" che vuol dire "considera tutte le parti di questo messaggio come alternative l'una all'altra e scegli la migliore da visualizzare".
Il mimetype giusto è invece multipart/mixed, che indica che c'è un allegato, così come riportato correttamente in messaggio.eml.
E' un errore sintattico generato dal programma di chi ti manda il messaggio e tu purtroppo non ci puoi far niente. Per sicurezza controlla il codice sorgente (CTRL U) dei messaggi di cui non vedi automaticamente gli allegati e cerca la prima riga dall'inizio che inizia con Content-type: se il valore è multipart/alternative il problema è quello.