Credo di aver risolto.
Dunque, se può servire ad altri.
1) Mi sistemo i preferiti come vorrei che fossero disponibili alla creazione del profilo.
2) Mi esporto i preferiti così sistemati in un file, bookmars.html
3) Individuo nella cartella browser all'interno della cartella di installazione di Firefox il file omni.ja
4) Apro questo file come fosse (lo è) un file .jar e dentro la cartella defaults/profile sostituisco il file bookmarks con quello appena creato.
A questo punto ogni nuovo profilo avrà i preferiti impostati come voluto.