Sì; estensioni come NoScript, Ghostery, RefControl, RequestPolicy e simili possono creare problemi nella completa fruizione di alcuni siti. Vietando i cookie di terze parti, il tracciamento, l'invio del referrer, gli script terzi... alcuni contenuti non funzionano.
Prima soluzione, mettere i propri siti fidati in white list.
Non dovesse bastare, oppure fosse necessario praticamente disabilitare una delle precedenti estensioni, usare un diverso profilo di Firefox magari con il solo AdBlock Plus.
Al posto di un diverso profilo di Firefox usare un diverso browser, per esempio SeaMonkey.