Sì, i programmi zip si possono installare tranquillamente su una penna USB o su un HD (purchè, ovviamente, non sia aperta contemporaneamente una sessione dello stesso programma già installato sul p.c.).
Nessun problema per la creazione delle cartelle personali.
Per gli aggiornamenti non lo so, io utilizzo la versione MozUp (non ti fornisco il link perché purtroppo non riesco ancora a collegarmi al sito di Mozilla Italia), ma credo che non sia dissimile dal MozUp.
In ogni caso, tieni d'occhio questa sezione:
tittoproject ha in serbo grandi novità e (spero presto) ci farà una gradita sorpresa...