Buongiorno.
Solitamente, a quanto mi risulta, non ci sono particolari problemi nel spostare/creare un Profilo in una posizione diversa, vedi queste indicazioni ->
Creare un profilo di Thunderbird in una posizione non standard Sono un po' datate ma la sostanza non cambia, questa per Firefox è più recente ->
Creare un profilo basta che sostituisci Firefox con Thunderbird.
A memoria, mi sembra un argomento che è stato già trattato, se fai una Ricerca senz'altro trovi qualcosa.
Il vero problema piuttosto lo vedo nel Raid, se questo si avvia mentre è in uso Thunderbird ho paura che qualche problema, serio, prima o poi arriva. Salvo che puoi impostare il Raid per l'avvio nelle ore notturne quando sicuramente TB non lo usa nessuno.