Buongiorno.
Beh, potrebbe essersi si corrotto il Profilo considerando anche le dimensioni consistenti delle Cartelle, poi pulite.
Quando hai eliminato le molte mail che avevi hai provveduto a fare la compattazione delle Cartelle?
Eliminare in blocco, es. 1Gb di mail, non è molto consigliabile con qualsiasi programma, meglio andare a piccoli passi e compattare di volta in volta.
Non ho mai avuto necessità di usare ImportExportTools e quindi non vorrei dire fesserie, ma se non sbaglio puoi anche importare delle singole Cartelle dal vecchio Profilo al nuovo, basta che siano riferite allo stesso account. Sempre però se non dico fesserie