Dei file msf non te ne fai nulla, sono solo degli indici con indicazioni per trovare velocemente le mail all'interno del file archivio. e in casi come questi è meglio farglieli rigenerare dopo aver importato i file archivio.
Non ho mai tentato una cosa del genere e non saprei che cosa suggerirti, non è che per caso hai la cartella Dati applicazioni dell che c'era prima di formattare?