@Mebabyte, le ultime parole famose...
In altra recentissima discussione
"Remove Duplicate Messages (Alternate)" l'ho installato anch'io ma non riscontro il problema.
In effetti il problema non era lo stesso (mancanza icone cartelle e degli account in seguito ad aggiornamento) ma evidentemente l'estensione interferisce anche nel mio caso.
Disattivato e tutto ok.
EDIT: ringrazio @Megabyte che in altro messaggio ha segnalato che l'aggiornamento dell'estensione risolveva varie disfunzioni causate "Remove Duplicate Messages (Alternate)".
Aggiornato ed è tutto ok anche nel mio caso.