@aramis, aggiungi le due istruzioni height.
/* Ridimensiona il pulsante e centra l'icona */
#appmenu-button,
#appmenu-toolbar-button {
min-width: 40px !important;
width: 40px !important;
min-height: 20px !important;
height: 20px !important!
padding: 1px 5px 1px 5px !important; }
min-height serve per forzare un'altezza superiore a quella della barra contenitrice (che si adeguerà di conseguenza).