Grazie per le indicazioni e scusate il ritardo. Sul sistema il predefinito è "Adobe Reader" mentre leggendo quanto riportato sul sito indicatomi da @Iceberg il plugin richiamto da FF è proprio per Acrobat e non mi è possibile fare una scelta, anche disattivandolo non cambia.
Comunque, visto e letto tutto rimango con lo stesso problema di non poter scegliere con quale applicativo aprire i file pdf.