è un discorso che esula dalle finalità di supporto di questo forum, comunque, non trovo molto impressionanti le applicazioni U3 per la "chiusura" del loro sistema. Prova qualcun'altro degli applicativi che ti ho consigliato: sono le uniche versioni portabili alternative che conosco. Prova prima a compattare le cartelle (cerca nel forum e troverai come fare)
Se nessuna delle alternative o la compattazione delle cartelle porta a performance migliori, posso pensare a una grossa dimensione delle mail cancellate, o a un "ingolfamento" fisiologico della pennetta.
Considera anche che diverse operazioni sui file di una chiavetta (copia di un singolo grosso file, modifica di un singolo grosso file, copia, creazione o spostamento di molti singoli file) possono portare a prestazioni molto differenti indifferentemente dalla velocità della chiavetta stessa.
Bisognerebbe anche controllare se la porta usb a cui è collegata è una vecchia usb 1.1 (più lenta) o una recente e veloce (ricerche su altri forum che trattano di hardware potrebbero risultare molto proficue).