Guardate, io ho provato su Windows e su Linux (in questo momento), stessa versione di Thunderbird: se dal menu File do "Compatta cartelle", il programma esegue la compattazione di TUTTE le cartelle, da "Posta in arrivo" a "Posta inviata".
L'ho monitorato con l'estensione di klades (quella che dà le informazioni sullo spazio utilizzato dalle cartelle).