Buonasera.
Nella finestra Impostazioni account, nella parte sinistra di questa dove ci sono i vari account, nella parte in basso trovi un pulsante con la voce Azioni account con a fianco una piccola freccia verso il basso, premi su questo pulsante così da aprire un nuovo menù, tra le voci di questo menù si trova Elimina account, clic sui questa voce ed elimini l'account selezionato in precedenza.
Per raggiungere la finestra Impostazioni account ci sono due strade, la prima dal menù principale alla voce Strumenti -> Impostazioni account; la seconda, premendo l'icona formata da tre righe orizzontali che trovi sulla destra poco sopra alla finestra delle mail (passando sopra con il mouse compare la scritta Mostra il menù di Thunderbird), selezionando la voce Preferenze o Opzioni e poi nel nuovo menù -> Impostazioni account