Buongiorno.
A parte seguire l'utile suggerimento di @Winfox con il quale poi sistemare le cartelle a tuo piacere, c'è da chiedersi però se quella struttura non sia impostata proprio da Kibibit, quindi ritengo sia impossibile da modificare. La stessa configurazione di Kibibit la usa Aruba Imap: cartella Posta in Arrivo, la principale; tutte al altre sono delle sottocartelle. E non sono mai riuscito a spostarle fuori da quella in arrivo salvo comprometterne il funzionamento.
Credo e temo che queste configurazioni siano un adattamento a IMAP di caselle POP, non rispettando quello che dovrebbero essere le impostazioni "convenzionali" per IMAP (almeno così ricordo di aver letto tempo fa che esiste un sorta di accordo su queste configurazioni).