Protect mode di Flash?
Potrebbe essere, ci ho pensato anche io, però non ho provato a disattivarla.
Dava problemi anche con Firefox ESR?
Eppure in FirefoxPortable.ini c'è questa istruzione: PluginsDirectory=Data\plugins
C'è nel tuo caso?
Sì.
EDIT: Con Firefox ESR "normale" e l'ultima versione di Flash non ci sono problemi.
EDIT 2: In conclusione, dopo svariate prove, ecco i risultati:
1) Firefox ESR "normale" e Portable non hanno problemi con l'ultima versione di Flash invece Tor Browser si blocca.
2) Firefox Portable ESR legge il plugin in entrambi le cartelle, Tor Browser invece solo in
app/firefox/plugins/.