Disinstallare e reinstallare Firefox comporta di "rigenerare" l'installazione.
Il nuovo profilo "rigenera" invece la configurazione.
I plugin di solito sono più legati all'installazione.
Magari prova.
Disinstallando, ti chiederà se vuoi eliminare i profili (in quel caso li chiama "dati personali"). Deseleziona l'opzione (così da non perdere i profili).
È appena uscito Firefox 6.
Magari prova ad installarlo (dopo aver disinstallato Firefox 5).
P.S.
Visto che stai facendo parecchi "esperimenti", ti conviene in ogni caso effettuare una "copia di backup" dell'intero profilo principale.