Devi usare il formato mbox.
Scegli "Esporta cartella con sottocartelle (con struttura)", avrai - per esempio - un file di nome Inbox e una cartella di nome Inbox.sbd
Per importarle in un altro TB, scegli "Importa file mbox" --> "Importa uno o più file mbox con le relative sottocartelle" e - nel nostro esempio - scegli solo il file Inbox, verrà automaticamente importata tutta la struttura.