Tolto il fatto che, a meno che tu non stia usando un lettore di file pdf molto vecchio, dovrebbe avere una funzione di ricerca integrata, prova ad aprire la gestine segnalibri, e a fare Menù File\Esporta dal vecchio profilo
Lo chiudi, apri il nuovo profilo, e fai Gestione Segnalibri, File\Importa e li ricarichi.
Per tutto il resto: probabilmente è un estensione che causava il problema.
REinstallale una ad una, verificando tra una e l'altra che firefox funzioni correttamente.
Se trovi la colpevole, non installarla più/cerca di capire con quale va in conflitto!
Poi, una volta rimesso tutto a posto, cancella il vecchio profilo, e cerca tra le FAQ del forum/FireFAQ come fare un backup del profilo, ed eseguilo!