Non ho capito bene, come
FLVPlayer hai installato
questo?
Perché, se è così, una volta che l'hai scaricato, isntallato ed aperto, basta semlicemente che trascini al suo interno il file
.flv che hai precedentemente salvato (oppure selezioni il suddetto file cliccando, in alto a destra del player, su
File...: ti si aprirà la finestra di ricerca dell'
Esplora risorse - credo si chiami così - del tuo sistema operativo, e non dovei fare altro che rintracciare il tuo video nella cartella dove l'avevi salvato).
Anch'io una volta usavo
VideoDownloader, poi sono passato a
Greasemonkey, che secondo me è più comoda.
La installi, poi vai
qui e, nel riquadro in alto a destra della pagina, clicchi su
Install this script:

Ti apparirà una piccola finestra che ti chiede di cliccare su
Install:

Tu lo fai e sei a cavallo!!

Poi vai su
YouTube, selezioni il video che vuoi scaricare, e noterai in alto una riga gialla:

Ci clicchi sopra, ti compare questa nuova finestra,

e scegli come salvare il tuo video!!
Io non ho mai riscontrato problemi, se vuoi provare...

Ciao!!
P.S.: Se vuoi uno script più selettivo,
in quest'altra pagina troverai lo script solo per
YouTube (è il nono della lista,
Download Youtube Videos).