Anche io lavoro con thunderbird e Gmail. Non mi reputo espertissimo...per cui aspetta anche altri consigli.

Con Gmail uso IMAP (devi averlo attivato su Gmail!):
> Apri Gmail e clicchi sulla rotellina a destra (parlo da PC ovviamente)
>Entri in Impostazioni e attivi IMAP cliccando su Inoltro e POP/IMAP
Attivato IMAP su Gmail, apri Thunderbird ed imposti la Gmail su Thunderbird.
Quindi la Gmail su Thunderbird in IMAP così le cartelle saranno sincronizzate.
Ora dalla cartella personale, selezioni i messaggi e li copi nella Gmail in Thunderbird.
Dovresti trovarteli anche in GMail.