Lo faceva anche a me su Mac anni fa e dovevo sempre spostarla manualmente. Poi a un certo punto, non ricordo come (forse un aggiornamento di versione) ha smesso di farlo.
Se dopo aver aperto la nuova finestra la sposti nella posizione corretta e la chiudi, riaprendo una nuova finestra continua a spostarsi?
Se provi dopo aver avviato Firefox in
Safe mode (<-clic) riscontri lo stesso problema?
Nella finestra di dialogo della modalità provvisoria di Firefox, fai solo clic su "Avvia in Modalità provvisoria".