Guarda, come sempre tutto va fatto con un minimo di attenzione: ad esempio, evitare di compattare le cartelle se si è in fase di ricezione di messaggi, sarebbe anzi meglio mettere il programma (o il PC) offline prima. Magari anche svuotare prima il cestino in modo che il programma debba compattare meno messaggi.
Oppure accertarsi che vi sia spazio disco disponibile e che il PC non sia impegnato in altre attività che interessano molto la CPU (del tipo montaggio video, ecc.) o il disco (copia o spostamento di file).
Detto questo, il problema può sempre capitare...