Uhm, strano
Io ho provato e a me funziona.
Se ti apre IE significa che il mailto non è configurato pper usare hotmail.
A questo punto se vai in Opzioni → Applicazioni, filtri con `mailto', che voci ti appaiono?
A me appaiono GMail, Yahoo! e Hotmail, oltre al client predefinito e alla scelta di un programma esterno. A te GMail, Yahoo! non appaiono?
Se fai un nuovo profilo appaiono quelle voci?