Avevo seguito personalmente una discussione su un problema identico al tuo solo che
riguardava Thunderbird e gli allegati. In quel caso file pdf, doc, venivano scaricati
nella cartella "Download" mentre l'utente li voleva salvare in una cartella personalizzata sul suo Mac.
Con il mio Mac OSX 10.3.9 (Panther), una volta fatta la modifica in Safari, riuscivo a cambiare
il percorso del download mentre lui che utilizzava Leopard no.
A questo punto non so se su Leopard sia possibile modificare il percorso.